Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP9P55211 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP9P55211 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP9P55211 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP9P55211 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP9P55211 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms