Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms