Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSFP46459 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSFP46459 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSFP46459 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSFP46459 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSFP46459 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSFP46459 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSFP46459 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSFP46459 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms