Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms