Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC1A4P43007 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A4P43007 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms