Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA2P42262 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms