Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHI3L1P36222 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHI3L1P36222 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms