Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHKAP35790 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHKAP35790 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHKAP35790 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHKAP35790 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHKAP35790 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHKAP35790 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms