Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A1P32418 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms