Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA3P32297 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms