Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3AP31941 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC3AP31941 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms