Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARK3P27448 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARK3P27448 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MARK3P27448 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARK3P27448 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARK3P27448 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARK3P27448 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARK3P27448 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARK3P27448 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARK3P27448 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARK3P27448 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARK3P27448 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARK3P27448 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARK3P27448 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK3P27448 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARK3P27448 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARK3P27448 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK3P27448 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK3P27448 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms