Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
DNMT1P26358 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
DNMT1P26358 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DNMT1P26358 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms