Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRBP23467 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PTPRBP23467 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRBP23467 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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