Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EPHA1P21709 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA1P21709 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms