Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB6P18564 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms