Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB8P17481 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms