Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAR2AP13861 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms