Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL11A1P12107 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL11A1P12107 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms