Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNB1P01574 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms