Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX58O95786 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX58O95786 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX58O95786 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX58O95786 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX58O95786 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX58O95786 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX58O95786 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX58O95786 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX58O95786 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX58O95786 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX58O95786 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX58O95786 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX58O95786 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX58O95786 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX58O95786 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX58O95786 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX58O95786 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX58O95786 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX58O95786 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX58O95786 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX58O95786 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms