Protein–RNA interactions for Protein: O76064

RNF8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF8O76064 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF8O76064 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF8O76064 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF8O76064 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF8O76064 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF8O76064 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF8O76064 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF8O76064 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF8O76064 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF8O76064 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF8O76064 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF8O76064 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF8O76064 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms