Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
BBOX1O75936 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BBOX1O75936 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms