Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL2O75678 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL2O75678 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms