Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP5O75197 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP5O75197 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP5O75197 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP5O75197 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP5O75197 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP5O75197 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP5O75197 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP5O75197 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP5O75197 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP5O75197 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP5O75197 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP5O75197 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP5O75197 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP5O75197 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP5O75197 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP5O75197 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP5O75197 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP5O75197 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP5O75197 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP5O75197 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP5O75197 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP5O75197 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms