Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNSO60931 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNSO60931 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNSO60931 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNSO60931 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNSO60931 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNSO60931 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNSO60931 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNSO60931 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNSO60931 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNSO60931 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNSO60931 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms