Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN1O60240 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN1O60240 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms