Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COCHO43405 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COCHO43405 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COCHO43405 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COCHO43405 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COCHO43405 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COCHO43405 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COCHO43405 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COCHO43405 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COCHO43405 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COCHO43405 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COCHO43405 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COCHO43405 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms