Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM6AO15550 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KDM6AO15550 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms