Protein–RNA interactions for Protein: O00292

LEFTY2, Left-right determination factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEFTY2O00292 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEFTY2O00292 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEFTY2O00292 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LEFTY2O00292 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LEFTY2O00292 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LEFTY2O00292 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LEFTY2O00292 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LEFTY2O00292 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEFTY2O00292 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms