Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPK3BL2E5RIL1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms