Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms