Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0U1RQF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQF3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms