Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv21A0A0A6YX06 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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