Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC23IPQ9Y6Y8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC23IPQ9Y6Y8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms