Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms