Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms