Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms