Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HHLA3Q9XRX5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms