Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NRXN1Q9ULB1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NRXN1Q9ULB1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN1Q9ULB1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms