Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA11Q9UKX5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA11Q9UKX5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms