Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNL1Q9UK58 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNL1Q9UK58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms