Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF223Q9UK11 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF223Q9UK11 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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