Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFMBT1Q9UHJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms