Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP4Q9UGJ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms