Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APEX2Q9UBZ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APEX2Q9UBZ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms