Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms