Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CWC25Q9NXE8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CWC25Q9NXE8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CWC25Q9NXE8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms