Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT57Q9NWB7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT57Q9NWB7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms