Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC38A7Q9NVC3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A7Q9NVC3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms